بهروز بقایی اولین بار با آزیتا احمدی متولد 1337، دختر زنده یاد مرتضی احمدی بازیگر قدیمی ازدواج کرد ، ثمره این ازدواج یک پسر متولد 1360 به نام بهرنگ می باشد.

ازدواج دوم
آقای بقایی بعد از طلاق از همسر اولش با پرستو گلستانی ازدواج کرد ، این زوج در سال 1375 در مجموعه نوعی دیگر باهم همکار بودند ، این زندگی مشترک نیز بعد از مدتی به طلاق ختم شد.
دلیل جدایی پرستو گلستان و بهروزبقایی
به هر حال ما همگی به دنبال خوشبختی هستیم. راه های متفاوتی هم برای دست یافتن به این خوشبختی وجود دارد. یکی از این راه ها ازدواج و تشکیل خانواده است.

اما گاه به جایی می رسی که می بینی آنچه را که می خواستی به دست نیاوردی و خب من هم نمی خواهم کسی را مقصر بدانم. بعضی وقت ها نمی شود و باید از صفر شروع کرد. خب من هم از صفر شروع کردم.

ازدواج سوم
بهروز بقایی پس از جدایی از پرستو گلستانی با همسر سومش ندا قاسمیان ازدواج کرد.